《辨证玉函》一书，历代目录学专书很少记载，民间亦罕流传。经查阅《四库全书总目提要》、《中国医籍考》、《医学读书志》、《四部总录医药编》，以及1962年北京图书馆出版的《中医图书联合目录》等目录学专书，均未收录本书。直至1991年中医古籍出版社出版《全国中医图书联合目录》始记载上海中医学院图书馆藏有此书残本（仅存二卷四卷），由此可见，此书湮没已久。