干祖望讲课语言生动，条理清晰，简明扼要，擅长总结某些理论研究成果，方便学生吸收记忆并运用。如“耳为肾窍肝胆附，鼻属肺窍阳明过，咽胃喉肺少阴循，舌心齿肾口唇土”，简单的四句话，把复杂的耳鼻咽喉口腔与脏腑经络关系联系起来了。他还写了“三字经”：如疼痛：风上腾，见表证；红而肿，热毒痈；肝阳升，痛必甚；虚象疼，轻而钝。瘙痒：皮肤痒，风和湿；多嚏痒，过敏质；喉久痒，相火炙。肿胀：红肿热，白肿痰，漫肿气，久肿衰。流脓：虚或寒，清且白；黄和稠，热毒迫。充血：深红热，淡红寒；久病晦，似猪肝；新病艳，如染丹。“三字经”朗朗上口，便于记忆，非常方便学生学习。
干祖望一生节俭，却将大部分节省下来的钱都花在买书上了。他的藏书非常丰富，除了浩如烟海的中医专业书籍之外，字典辞书、四书五经、佛学道教、天文地理、古史今说、格律诗词等各种书籍无所不包，其中更有不少珍本、善本的线装书。更难得的是，干祖望非但爱书，更善于保管书籍。他将书一一分类，编号四十余门，排列有序，要使用时可以轻而易举，信手拈来。他将自己的书房名为“茧斋”，一者极言其小，二来，他以书房为蚕茧，在茧斋中不断充实自我，吐丝作茧，以期有一日可以破茧成蝶。尽管全家都依靠他微薄的收入维持生计，尽管工作非常繁忙，他还是将自己所有的业务时间和金钱都投给了他挚爱的书籍，正因如此，他曾写下“人瘦因工作，家贫为买书”的对联以自况，人们送了他一个“书痴”的雅号。1990年元旦，南京文化界评选“藏书状元”，干祖望曾在数百人的角逐之中荣登榜首，获封“金陵藏书状元”。
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