潘澄濂在《伤寒论新解》中，突破了“注不破经，疏不破注”的窠臼，对《伤寒论》“阳浮”和“阴弱”、“营弱”和“卫强”以阳和卫代表机体的散温机能，阴和营代表机体的产温机能作了解释，认为太阳中风就是散温机能的亢进，产温机能不能相应地随着旺盛，使机体调节中枢的相对平衡失调，所以虽自汗出而不解。又据《伤寒论》“病发于阳，而反下之，热入因作结胸……所以成结胸者，以下之太早故也”条看，结胸是因早下而致，但原书对结胸的治疗，恰恰是采用大陷胸汤的峻下。这样，前后似有矛盾，不易理解。他援引西医理论作剖析，指出从《伤寒论》对结胸的描述，先说“舌上燥而渴，日晡所小有潮热，从心下至少腹鞭满而痛，不可近也”，又说“结胸无大热者，此水结在胸胁者也”，据此推测结胸的实质似指胸腔有大量渗出性或漏出性积液，病变的主要部位在胸腔。就胸腔积液而论，临床上以渗出性胸膜炎较为常见，其病开始阶段，往往先出现恶寒发热，或胸胁疼痛，咳嗽等表证。《伤寒论》对有表证者，一般先解表，表解乃可攻里，所以文中“病发于阳”的“阳”字，可能是指结胸的开始阶段有恶寒发热等表证而言，因此认为不宜过早攻下，过早攻下，损伤正气，于病不利。但是，渗出性胸膜炎由于炎症的进展，恶寒、脉浮之类的表证可以自罢，表证祛并非病已愈，相反，胸膜积液增多，则肺部压迫症状如胸闷、胸痛、气急或咳嗽等势必加重。由于古无X线检查，又无穿刺抽液，而能认识“此为水结在胸胁者也”，采用具有泻下作用的大陷胸汤（丸），诱导积液排泄，借以减轻胸部之压迫，殊属可贵。由此他认定结胸先谓不宜下之过早，后仍以攻下取效，实非因攻下过早而成结胸，也不是结胸不宜攻，而是因病变的发生和发展阶段有表里之不同，故治法也当有先表后攻之分寸，这正是仲景辨证论治精髓之所在。诸如此类，引用西说解释，析义明理，较之以经解经，是一个飞跃。

潘澄濂在《卫气营血辨证在温热病学上的作用和意义》一文中详细地论述了卫气营血辨证与急性传染病的关系，指出叶天士所说的卫气营血并非指某些病毒损害的器官组织，而是将各种急性传染病的发展过程中所表现的证候，以综合和辨证的方法，划分为4种不同的证候群，作为治疗的标志。谓急性热性传染病的发作，取决于病原体在机体内生存的适应力和机体对病原作用所产生的反应，不论是病原体的内毒素或外毒素，毒血症或菌血症，所引起的病变能影响整个机体的生理机能。如疟疾一般征候表现是：寒热往来，呕吐，消化不良，体疼，脾肿，苔白腻或黄腻，也有独热不寒，舌光绛，神识昏迷的。又如肠热病（肠伤寒），一般在第一病周时，有轻度的恶寒和发热，口渴，或渴不引饮，苔薄白或黄腻，皮肤间现蔷薇疹。到了第二病周，由于病热进展，体温稽留在中等度以上，舌焦燥，或光绛而干，甚者神昏谵语，大便秘结或下痢。就这两病的发展过程来说，疟疾的一般症候，和肠热症第一病周时的临床象征，按卫气营血辨证，系邪在卫分或气分，而当出现舌光绛而干，神昏谵语，即属邪入营分或血分了。这样的划分归类，以西医论来说是难理解的，但就中医学说而言，确实如此。他进而指出，卫分阶段，津液一般未受耗伤，故用发汗或渗湿；病热发展，进入气分阶段，就有劫津耗液的可能，治用清法，有湿的尚可化湿；到了营分阶段，津液耗灼，神经系统受到了威胁，表现为舌光绛而干，唇焦齿垢，神昏谵语，如再有心力衰竭征候出现，便是进入极期，治以滋润养阴，还要顾及心脑机能衰竭，适当采用至宝丹、安宫牛黄丸、紫雪丹等，以防痉厥；如进入血分阶段，血毒征象已很严重，有各种出血症，须以大剂凉血解毒。凡此，中西两套理论同用，指导临床实践，有利于明理识证，提高疗效。

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