薛伯寿崇尚岐黄、老子道家思想，倡导和合思想，无论是治病还是养生，倡导古文化及其哲理为指导，遵循淳朴自然辩证法。重视伤寒杂病、温病、温疫的研读；尊敬名师，虚心求教。认为中医必须坚持与时俱进，融合现代科学发展成果，西为中用；临床对许多经方时方皆有心得发挥；强调重视临床实践，在缓承基础上开拓创新。
薛伯寿认为诊治外感热病是铸就高水平临床人才的关键，治疗外感热病当融会贯通伤寒、温病和温疫学说；要处理好邪正关系，注意兼挟；掌握标本关系而顾护胃气；辨清患者体质方可提高疗效。
薛伯寿认为调畅气血为治外感病，尤其内伤杂病、疑难病证，甚至为防治衰老皆必循本法。精通方药配伍，择善选药为提高疗效关键之一。认为补药的堆积，既不能防病亦不能治病。认为既有怪病从痰治，亦有顽疾从瘀解。疑难病证治病求本，必须考虑到痰饮、瘀血、积滞等病理之论。
· 人物评价
“薛伯寿为杰出的临床家，行医六十载，注重个体化诊疗，以仁者之心，恪守医德，始终为患者考虑，处方轻灵，价廉效佳。”（中国中医科学院广安门医院评）
“薛伯寿尊道贵德，淡泊名利，乐于奉献，举手投足间透出坚韧的气质。他治疗热病，效如桴鼓，传承育人，无私奉献，对待病人如春风般温暖，为无数患者带去希望。”（首都文明网评）
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