精神因素（包括神经性）引起的肛门疼痛：对精神神经因素引起的疼痛，首先要从心理上给予治疗，同时，适当给予维生素及安定类药治疗。对神经因素引起的肛门痛，如坐骨神经痛，要诊断导致坐骨神经痛的具体病因，从而解除病因，肛门疼痛的症状也就好了。
肠道感染、便秘和腹泻：对于这种情况引起的肛门疼痛可以运用抗生素或通便药等进行对症治疗，肠道感染、便秘和腹泻病情得到控制或治愈，肛门就不会再疼痛了。
肛门直肠周围感染或脓肿导致的肛门疼痛，可以采用及时切开引流或行根治术的方式，比较快速。
肛门疾病和肛门肿瘤导致的肛门疼痛应及时治愈痔、瘘、裂等肛门疾病，手术切除肛门肿瘤，肛门自然疼痛减轻。
良好的生活习惯，饮食习惯可以改善肛门疼痛，好的饮食可以保持排便的通畅，要多吃一些蔬菜。改善便秘，那些刺激的食物,辛辣的食物都尽量要少吃。吸烟，喝酒有害健康，对自己的消化系统也有较大的负担，因此要控制。
要注意个人的卫生，特别是肛门处的卫生。要努力地保持该处的清洁。那些过紧的内裤也尽量不要穿，因为这样会影响患处的血液循环，甚至会加重肛门疼痛的病情。
最后病情严重建议到医院进行相关的治疗，这样才能更快的药到病除。需要提醒一下的是,肛裂有较小的可能是其他恶性肠道疾病，甚至是肿瘤的症状，是不能轻易忽视的，肛门疼痛也不是小事情。
另外想要预防肛门痛的话，那就要预防便秘的现象发生，要合适的饮食及良好的卫生习惯，应该大量饮水。
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