姚氏认为眼睛与脏腑息息相关，阴阳失调，脏腑偏胜，旁及自然界的变化，人事的变迁，外来影响等均为眼病之因。故临诊强调整体观，辨证论治，内外结合，表里兼施，每多奇效。姚氏兼善针拨白内障，一针复明者不可数计。所撰《针术治疗白内障初步小结》发表于《中医杂志》。
· 姚和清著作
并转载于第一版《中医学概论》内，引起眼科界重视，予以推广。还先后发表《中医对原发性青光眼的认识与治疗》、《球后视神经炎及其萎缩的认识与处理》、《中药治疗麻痹性斜视病例报告》、《中医对角膜软化症的治疗》、《沙眼简易疗法》等十数篇论文，其学术经验曾在《近代中医流派经验选集》、《海上医林(中医专辑)》介绍。由其子整理的《眼科证治经验》专著，上海科学技术出版社于1978年出版。
· 强调整体观念
大量医案提示，姚氏治病，始终掌握了整体观念与辨证论治的中医特色。认为眼具阴阳，眼由脏腑精气腾结而成，眼内各组织皆与内脏相应，因而其所表现的生理功能与病理变化，能直接或间接地反映出内脏的情况，鉴于此，对待眼病，必须视作为整体的局部病变，决不可单认为是眼本身的变化，眼病形成，全系阴阳失调，脏腑偏胜，如果能正确掌握治病求本原则，掌握整体观念，进行辨证论治，以纠正偏胜，调和阴阳，沉疴亦能挽回。姚氏曾说：眼科五轮学说是提示眼与整体之联系，在很多情况下，能解释眼的生理病理现象，对治疗亦具一定指导作用。但古人用于临床，很多是过分偏重局部体征，过分强调五脏主病，对因脏腑偏胜同时引起的其他证候，绝少考虑，所以对眼病不问症状如何，皆臆断其由脏受病，至于眼病各个症状之相互联系，更缺乏整体认识，从而产生一证一方的片面治疗观点，这是与整体观念相违背的。因此，姚氏强调：对待眼病必须全面看问题，要把眼病各个症状及整体所出现的表现结合起来，看其相互关系，从中分别主次，找寻阴阳偏胜与五行生克规律，然后议定方药，才真正符合辨证论治法则。
在强调整体观念的前提下，姚氏相当重视探求病因病机，因为这是治病求本的一个主要方面。病因可从眼局部与整体所表现的各种征象探求，但有时全身症状不明显，则需要详细分析病史，找寻旁证对天地间自然界的骤然变化，人事的变迁，以及突然发生的体征，更加予以注意。然后应用阴阳五行藏象经络与五轮学说等作深入细微分析，达到治病求本的目的。同时，姚氏认为治病原则必须掌握，但亦有一定灵活性，需要随机应变，结合辨证论治。因为眼病病因复杂，症状出现，可随各个阶段有所不同，特别当情志波动、饮食失节、起居违和、天时变化、妇女胎产经带，以及用药不当时，皆可对眼部病变有所影响，所以治疗用药必须注意病证转变，从转变中看其阴阳进退，邪正消长。姚氏多次告诫说:为医者必须行方智圆、胆大心细。所谓智圆，就是医者必须注意病人的各个方面，譬如禀赋厚薄、年岁老小、身形肥瘦、性情缓急、境遇贵贱、病情新久，以及天时风俗、生活习惯等等，要知常知变，能神能明，要因人因时因地制宜，才合乎医道。
· 重视乙癸同源
肝开窍于目而主于肾，肝肾对眼的生理病理关系深巨。由于肝肾彼此间关系密切，并因乙木属肝，癸水属肾，所以古有乙癸同源之称。姚氏对这个理论相当重视，而且广泛应用于临床，取得一定疗效。姚氏说:肝肾之相互关系，主要表现在母子相生，而目为肝之外候，肝取木，肾取水，水能生木属肝，母子相合，则肝肾之气充沛，目受其荫，故而放明。如果母子不合，则无论是子盗母气，或者母令子虚，皆能使肝肾之气不足，不足则精气无法上荣，目失所养，眼病随之而起。《经》曰：“肝受血能视。”“肝气通于目，肝和则能辨五色。”又云：“五藏六府之精皆上注于目而为之睛”，而肾藏精，所以目虽为肝窍，而以肾为主，子母相生，肝肾同一治也。且肝肾同为相火所寄，相火内阴而外阳，其性主动，而具生命活动之能力，但易妄动，妄动则变为邪火而贼人身，及于眼。目之能视惟赖神光，神光源于命门，通于胆，亦火之用事。火衰则目昏，火炎则目焚，肝肾相火对眼之生理病理具有相当重要意义。
进一步分析眼内组织构造，则五轮中风轮属肝，水轮属肾，眼内神膏为胆中渗润精汁，升发于上，积而成者。神水为先天真一之气所化，神光源于命门，通于胆。真血即肝中升运滋目注络之血，真气为目内经络往来生用之气，真精为先后天之气所化之精汁，起于肾，施于胆，而后及于瞳神也。目系与脑相连而厥阴肝脉系之，同时少阴肾脉附督上额交巅络脑，又与肝脉相合，说是肝肾对眼的各个组织的关系至为密切，所以当肝肾亏损，必然影响以上组织而发生疾病。
临床上因肝肾病变而引起的眼病，为数颇多，诸如青盲、内障、能近怯远、能远怯近、视惑、视歧以及外障等，在很多情况下，都可能与此有关。发生病变的主要因素，在于肝肾精血两亏、阴不上承；阴虚生内热、虚火上炎；真阴不足，龙雷之火上游，以及水不涵木、肝阳偏亢、化风、化火等几个方面。因而治疗用药必须按照不同病因而正确掌握，古人提出的“壮水之主，以制阳光”、“益火之源，以消阴翳”，就是针对这方面的治疗原则，为眼科临床所常用。至于育阴潜阳、养肝熄风以及滋肾填精等法，亦可根据不同病情而选用。
· 善于博采众方
姚氏治疗眼病善用成方，认为成方为古人实践经验的总结，相当宝贵。如能善于运用，斟酌加减，可以事半功倍。所用方药，多宗内科。曾谓：“眼病系整体疾病，治病必求其本，必须辨证正确，病因分明。如果原因相同，则内科方可治眼病，眼科方亦可治内科病，何必有内眼之分”。用方则各家学术兼收并蓄，毫无偏见，对仲景方则特别推崇，善用经方。姚氏认为：“眼具阴阳水火，而伤寒温病之发生，亦系阴阳水火偏胜，所异者，所犯病变部位不同，出现症状不同而已。”姚氏十分重视古人治疗眼病的经验，无论哪一种疗法，以至单方、验方等等，无不笔录，供临床参考。姚氏认为很多眼病单靠内治不能完全解决问题，需要使用多种疗法，才有可能药到病除。因此，姚氏不独精于内治，亦善于外治、割治；非独精于眼科，亦通晓内科，对一般外科、针灸与气功等，都有独到心得。
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