乾隆年间，太医院的教学缺少一部统一、规范的教材。当时流行的医学书籍种类繁多，有的过于深奥，有的过于简略，还有不少错误。太医院院判吴谦和刘裕铎上书乾隆皇帝，请求编撰一套供太医院教学和诊疗用的标准医学丛书。
乾隆皇帝批准了这个请求，为此专门设立了“医书馆”，组织了庞大的编纂团队，其中纂修官14人、副纂修官12人、校阅官10人、誊录官23人，加起来超过六十人参与这项工程。
——三年成书，九十卷
编纂团队做了几件事：
· 把宫廷收藏的历代医书全部整理出来；
· 下令全国征集民间医书、家藏秘方和经验良方；
· 由太医们集体讨论、校订、删补。
经过三年努力，乾隆七年（1742年），《医宗金鉴》九十卷正式刊行。全书分为15种，涵盖了从基础理论到临床各科的全部内容。
——书里有什么
· 基础理论部分：《伤寒论注》《金匮要略注》，吴谦亲自主持订正，把张仲景的经典条文逐条注释，并纠正常见的理解错误。
· 诊断与方剂：《四诊心法要诀》讲望闻问切，《删补名医方论》精选历代名方并附注解。
· 临床各科：《杂病心法要诀》《妇科心法要诀》《幼科杂病心法要诀》《外科心法要诀》《眼科心法要诀》《刺灸心法要诀》《正骨心法要旨》等，覆盖了内、外、妇、儿、骨伤、针灸、眼科等所有领域。
· 正骨八法：在骨伤科方面，《正骨心法要旨》系统总结了正骨八法——摸、接、端、提、按、摩、推、拿，被后世奉为骨伤科的核心手法。
· 痘疹与种痘：书中还记载了当时世界上最先进的种痘技术（预防天花），包括水苗法、旱苗法等，这在18世纪是领先世界的医学成就。
· 歌诀体：让医学生好背好用
《医宗金鉴》最大的特点之一，是采用了歌诀体裁。把各科证治编成韵文，读起来朗朗上口，便于记忆。歌诀下面附有详细注解，既方便老师讲解，也便于学生自学。那时的已然成了太医院的标准教材，后来传播到民间，也是清代习医者必读的经典。
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