1.业务
在藏医临床及药物研究方面他主持和参加了四项省、部级重大科研课题。其中藏药治疗萎缩性胃炎，总有效率达96%，获卫生部科技三等奖，这是西藏卫生界到目前获得的最高奖项；运用现代医学的诊断和服用藏药方法来研究肝炎疗法，研究期间强巴赤列院长亲自临床观察和指导，翻阅钦绕罗布老院长传授的祖传秘方记录，经过一年的潜心研究，研究取得成功，现在藏医院建立了肝胆专科，有藏医治疗肝炎的效率达95%以上；他主持的用藏药红景天和茅膏菜抗衰老、抗缺氧，提高免疫功能的研究工作成为西藏首例研究国家级新药首例，而且首次获国际自然科学基金会资助的唯一课题；他不仅组织指导科研攻关，还很重视藏医药学术研究工作。每年邀请国内外专家学者进行学习交流，加强藏医药在国内外的影响，为建立学术联系网络作了重要工作。他先后赴尼泊尔、日本、美国等国家讲学，与日本自治医科大学、美国克罗拉多大学、德国汉堡大学建立了密切的学术协作关系。
2.科研
为了抢救藏医药和天文历算资料，从1980年开始，他抽调人才，成立了图书抢救小组，负责搜集、整理、复制、抄写、绘制、雕刻书版等工作，如今藏医院资料室已保存各种论著7000多种部。为了继承和发扬藏医学这门古老而又实用的科学，更好地为人民健康事业服务，培养后继人才，建立了丰富的经验资料库。
3.交流
1998年9月11日至20日，北京和西藏的藏医专家赴台湾参加台湾中医研究所及台北国父纪念馆等联合举办的海峡两岸中医、藏医学术交流活动。强巴赤列院长为中国代表团团长，在历时十天的会议上，强巴赤列院长举办讲座五次，向台湾同胞广泛介绍了祖国优秀医学财富之一的藏医药以及当代西藏藏族传统文化的保护和弘扬的情况。每次讲座都是听众爆满，座无虚席，有时走廊上和台阶上也挤满了人。中国台湾方面参加会议的官员、学者、医药界人士对藏医药表现出极大的热情和兴趣。并与台湾中医药界建立了友谊，促进了相互了解和沟通，为今后中国台湾中医界和西藏藏医界的交往和交流开了个好头。
4.管理方法
自八十年代以来，他任院长期间，藏医院常年开展门诊、住院、家庭病床、巡回医疗、国内外信诊邮药室等多种服务形式，每年就诊人数达30万人次。作为国家级专家的强巴赤列院长倡导的高尚的医德医风在藏医院已尉然成风。藏医院被选为自治区文明优质服务先进单位，强巴赤列院长也于1988年被卫生部评为全国医院优秀院长。
5.实践
藏医学具有自己独特的医药理论和实践经验。强巴赤列教授主张严格保持和发展藏医的传统特色，不能让西医牵着鼻子走。但是，他还是一个开放型的藏医，坚持“拿来主义”的观点，吸收一切对藏医药自身发展有益的现代医学技术。所以，藏医院开设了藏西医结合科及病房，采用胃镜、心电图、X光机、B超等现代医学的诊断技术，以提高藏医在诊断方面的准确度。使用了西医麻醉技术，也使古老的藏医手术得到复生。
6.发展
藏医学正处在一个飞速发展的时代，一切依赖于大批优秀人才的涌现。他十分重视藏医教育。1989年9月，西藏大学藏医系与藏医学校正式合并，升格为西藏藏医学院，当时强巴赤列担任院长。他所写的教材；是藏医学院的教材之一，每年开学之际，他还要讲授《藏医传统医德规范》和《藏医师承学》，注重未来藏医的医德医风建设。1993年他开始撰写《中国藏医》。此书1996年由中国藏学研究中心出版社出版（藏汉两种版本）。还出版了《藏医院志》、《真诚的鼓舞，诚挚的寄托》、《强巴赤列著作选集》等五部著作，十几篇论文。
7.教育
为藏医院医生，外地来的进修生、民间医生，实习生等将近100名学生讲授藏医理论学，藏医临床学、医德医风、藏医历史等重要课程。将自己渊博的知识毫无保留地传授给后代，他先后培养了五、六百名学生。
8.诺言
倡导并负责创建藏医学院、藏医院研究所、天文历算研究所以及扩建自治区藏医院。为藏医事业的发展、提高藏医药学术水平和临床实践水平、医德医风等做出了大量的有益的工作。他倡导藏医优良传统与现代科学管理方式的结合，使西藏自治区藏医院的管理工作独具特色，江泽民总书记视察藏医院时曾称赞强巴赤列“管理有方”。