周仲瑛在学说上主张不执一家之说善于综合应用各家学说之长从应用中求发展通过实践提出新的论点和治法。如认为流行性出血热主要表现为卫气营血的传变经过并见三焦、六经形证因此应综合温病、伤寒等各家学说针对出血热各个病期的病理特点制订相应的治法和方药并提出“病理中民在气营”的新论点使疗效得到显著的提高病死率降到1.11%低于当时报道的全国平均值3.45%处于国内领先地位对某些感染性高热重症有卫气营血传变者主张到气就可气营两清阻断病情发展邪热入里者应早予通利从而明显提高了病毒性高热重症的疗效对厥脱证休克的研究提出“气滞络瘀、内闭外脱”为其基本病理特点从而首创气血同治行气活血与扶正固脱合法并创制辨证系列注射剂治疗例病死率4.41%明显优于对照组已列为国家新药开发课题对急性肾功能衰竭的研究提出“三毒”热毒、血毒、水毒学说认为“瘀热水结、阴津耗伤”是其病机、病证特点确立泻下通瘀、滋阴生津治法研制成泻下通瘀合剂治疗例显效率88.6% 总有效率96%明显高于西药对照组的 42.9% 和78%。在科研中重视应用现代科学方法进行较为系统的实验研究阐明其理论实质及药物的作用机理从而对中医理论有所创新和发展也有助于提高中医学术水平和临床应急能力。
倡导“病理因素第二病因说”。强调重视气血的关系及痰瘀在诸多疾病中的病理作用。如对高血压病、厥脱休克的研究强调从气血立论按调气和血立法对出血热、乙型肝炎的治疗常从瘀热着眼并首创“瘀热型血证”这一特殊证型进行深入系统的研究对高脂血症、动脉粥样硬化、类风湿性关节炎等疾病则以痰瘀痹阻为论治根据。
一贯强调中医学的优势在于临床诊病必须发扬整体观念和辨证论治的特色提出“审证求机论”认为辨证应首重病机病机为理论联系实际的纽带通往论治的桥梁病机词汇则是表达所得印象的理论核心既有高度的概括性又是进一步演绎分析的基础。若症候交叉复合病机错杂多端者则采用不同词汇组合表达并体现其内在因果联系。辨证既求规范使理法方药相互联系。如苦辛通降治胃痞酸甘复合养胃阴脾胃疾病每易虚实相兼、寒热错杂故常以温清通补复合应用等。治疗肿瘤既重视对瘤体本身的治疗即杀灭或抑制肿瘤细胞中强对整体正气的扶助既注意肿瘤在发病机理上的共性又寻求不同部位肿瘤的特殊性而采用特异性治疗措施既遵循辨证论治原则总结中医防治肿瘤的基本规律制定诊治常规又重视辨病治疗制定有效专方专药提高疗效。用言善于变通精于识辨类方的异同选药从同类药的共性中寻求个性讲究配伍关系。
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